Esto se puede hacer de las siguientes dos formas:
git clone /home/usuario/proyecto.git
o
git clone file:////home/usuario/proyecto.git
La diferencia entre estos dos métodos es que al usar el prefijo file://, este es mas lento1 pero obtiene una copia limpia en caso de que este repositorio haya estado bajo otro sistema de control de versiones.
Fuentes
Git on the Server - The Protocols
1 Al usar el prefijo file, GIT utiliza un proceso para transferir datos sobre una red. Lo cual lo hace mas lento.
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